Thyroid:基于DNA甲基化的方法鉴别肿瘤良恶性病变

2022-01-10 03:40:24 来源:
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背景:由于细胞学检查的局限性,细针穿刺活检(FNAB)比对诊疗肾脏骨盆并不是金标准。分子标记有可能借以缺少基于FNAB的诊疗并有可能会不必要的手术。在本项数据分析之中,数据分析部门旨在确定DNA转录动物遥相呼应是否可以使用作为肾脏炎症的诊疗工具。分析方法:数据分析部门将状(PTC = 60)和滤泡性(FTC = 10)肾脏癌的全基因组DNA转录谱(Illumina 450k)与非组织比对(NT = 50)和良性肾脏炎症(BTL = 17)来进行相比较。并在Gene Expression Omnibus(GEO)和The Cancer Genome Atlas(TCGA)的公开可用检索之中证实了结果。为了减少该分析方法的适用性,数据分析部门必无需六种区别转录的CpG,并在161个肾脏和69个BTL术后标本之中来进行评估,并使用亚氢盐-焦磷酸测序对前瞻性收集的55个FNAB来进行评估。结果:DNA转录分析辨识PTC和FTC之中分别有2130和19个区别转录的CpGs。基于6个CpGs的模型能够区分良性和恶性肾脏炎症,敏感性为94.3%,依赖性为82.4%。将该分析方法应使用TCGA和GEO举例来说数据集(91.3-97.4%灵敏度,87.5%依赖性),推断出了类似的稳定性。论点:基于DNA转录的监测分析方法可使用术前筛查肾脏骨盆良恶性炎症。有可能借以有可能会不必要的肾脏手术。原始应是:Mateus Camargo Barros-FilhoDr. Et al. DNA methylation-based method to differentiate malignant from benign thyroid lesions. Thyroid. 2019.本文系梅斯针灸(MedSci)原创程式码重新整理,刊发无需授权!
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